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个喜(c)PxB-Cy3探针(绿色)和Vanco-Cy5探针(红色)分别靶向标记小鼠肠道菌群的阴性菌和阳性菌。(d)或者利用遗传操作工具使肠道细菌表达荧光蛋白、欢玩荧光素酶或者气泡,来对肠道细菌进行荧光成像或超声成像。接下来,捆绑详细讨论了,基于代谢标记的非天然糖和稳定同位素的成像策略,在不同情景中和多种尺度上对肠道细菌进行成像。
首先,神奇作者总结了在开发抗生素衍生的荧光探针方面所做的努力,该探针直接结合特定的细菌表面结构,以实现选择性标记不同种类的肠道细菌。女侠(d)RNA探针代谢标记肠道细菌新合成的RNA。
(b)利用基因工程技术使大肠杆菌形成充气的蛋白质纳米结构(气泡)来反射超声波,原的学进而超声成像小鼠体内的大肠杆菌。
然后,个喜文章介绍了基于核酸染色的细菌成像,个喜使用一般的核酸结合试剂或选择性标记技术(例如荧光原位杂交(FISH))来满足各种应用场景中肠道菌群研究的需求。此外,欢玩尽管在许多的肠道共生细菌中进行基因操作存在极大的困难,欢玩但科学界最近在利用荧光蛋白和声响应蛋白等报告基因来改造肠道细菌方面也做出了巨大的努力。
捆绑(b-c)利用代谢寡糖工程(MOE)对肠道细菌进行成像。文献链接:神奇ImagingCommensalMicrobiotaandPathogenicBacteriaintheGut,Acc.Chem.Res., 2021,DOI:10.1021/acs.accounts.1c00068本文由材料人学术组tt供稿,材料牛整理编辑。
【图文导读】Figure1.用于研究肠道细菌的成像工具主要包括抗生素衍生的荧光探针、女侠代谢标记探针、女侠核酸染色探针和基因编码的报告基因(a)万古霉素(Vanco)衍生的荧光探针靶向革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖中的D-Ala-D-Ala结构,多粘菌素B(PxB)和十三碳素A(TriA)衍生的荧光探针则分别结合到革兰氏阴性菌的脂多糖和脂质II结构上。原的学(e)TriA-TAMRA(红色)和Vanco-BODIPY(绿色)分别标记小鼠肠道菌群的阴性菌和阳性菌。